謝邀，我是倮倮，我來宏觀的回答一下：昆明和大理都是云南的兄弟城市，都是新中國(guó)后第一批歷史文化名城。這里是只理性敘述發(fā)生過的歷史脈絡(luò)，不刻意比較優(yōu)劣，（希望大家理性看待）。
【宏觀歷史發(fā)展】
▲古滇博物館效果圖（網(wǎng)絡(luò)圖片）
云南有兩個(gè)【第一批國(guó)家歷史文化名城】，那就是昆明和大理，兩個(gè)城市都有著輝煌的歷史和文化，而且在歷史上都做過云南的政治中心（郡治/首都/省會(huì)）是云南最有歷史底蘊(yùn)的兩座雙子星城市。歷史上云南的統(tǒng)治中心，并不是一成不變的。歷史脈絡(luò)大致是，最早（前秦兩漢時(shí)期）在今昆明地區(qū)滇池流域（王城/郡治），后來（三國(guó)魏晉南北朝）移至曲靖地區(qū)（郡治），又到(隋唐至兩宋時(shí)期)的南詔國(guó)、大理國(guó)（首都），最后（元明清）又回昆明（省會(huì)）。
【古滇國(guó)和南詔國(guó) 簡(jiǎn)介】
▲云南省博物館古滇青銅器（網(wǎng)絡(luò)圖片）
【 古滇文明 】是云南3000年青銅文明最耀眼的文明代表。初期范圍為滇中地區(qū)（今昆明地區(qū)+今玉溪地區(qū)），楚將莊蹻建國(guó)后打敗了滇西昆明族，勢(shì)力擴(kuò)展至滇西地區(qū)。
▲云南最古老的畫《南詔圖傳》（網(wǎng)絡(luò)圖片）
【 南詔國(guó)時(shí)代 】的彩云之南，是云南地方政權(quán)最強(qiáng)大的時(shí)代，疆域約79萬平方公里（面積是現(xiàn)在云南面積（39萬）的約一倍大，而且軍事實(shí)力也不容小視，堪稱地區(qū)小霸，外交游走于大唐和吐蕃兩大國(guó)之間）。
歷史脈絡(luò)大致如下：【前秦時(shí)代的昆明地區(qū)】
【文明之光】公元前475年—公元220年
＊【時(shí)間跨度】戰(zhàn)國(guó)——秦——前/后漢【約300年】
＊【政治地位】古滇王國(guó)王城 /郡治（益州郡）
＊【古滇國(guó)奠基人】楚將-莊蹻（第一代滇王）
＊【昆明地名淵源】 昆明 最早是指滇西洱海流域的部落【昆明人】，而非地名。 昆明 即【昆明千戶所】在元朝時(shí)正式成為官方地名記載于史書中。
＊【最早文明的誕生】滇池地區(qū)擁有3000年的文明史，滇中地區(qū)湖泊眾多（高原5大湖泊環(huán)布四周）加上寬闊的盆地等先天自然優(yōu)勢(shì)，讓滇中滇池流域誕生了云南最早最悠久的【古滇青銅文明】。古滇先民率先結(jié)束茹毛飲血的游獵生活進(jìn)入初級(jí)文明時(shí)代，成為當(dāng)時(shí)云南相對(duì)先進(jìn)的農(nóng)耕民族。
＊【云南最早的城池出現(xiàn)】（紀(jì)元前298～277年間）楚將莊蹻入滇征服當(dāng)?shù)赝林?，返途被秦?guó)所阻，索性建國(guó)筑城名為【苴蘭城】也稱莊蹻故城（今晉寧區(qū)晉城鎮(zhèn)），因此今昆明擁有2200多年的建城史有此開始。
【延伸點(diǎn)一】先秦時(shí)代云南大致誕生了三個(gè)相對(duì)強(qiáng)大的地方勢(shì)力，分別是：
1.滇中地區(qū)—古滇國(guó)（古滇人）
2.滇西北—昆明族部落（昆明人）
3.滇西南—古哀牢國(guó)（傣族先民）
▲莊蹻故城想象復(fù)原圖（網(wǎng)絡(luò)圖片）
▲益州郡地圖（網(wǎng)絡(luò)圖片）
【三國(guó)至南北朝時(shí)代的曲靖地區(qū)】
【南中大姓—爨文化】公元220年——公元589年
＊【時(shí)間跨度】三國(guó)—兩晉—南北朝【約400余年】
＊【爨（cuàn）文化】公元339年-公元794年
＊【政治地位】郡治（益州郡/建寧郡）
＊【地方政權(quán)奠基人】爨琛，（三國(guó)末期生人，跨越西晉，東晉時(shí)云南地方爨氏政權(quán)創(chuàng)建者）
▲爨寶子碑
▲建寧郡地圖（網(wǎng)絡(luò)圖片）
【延伸點(diǎn)二】【南中大姓】有爨、孟、李、董、雍、毛、朱、呂等大姓，為（公元前1世紀(jì)—公元4世紀(jì)兩漢至東晉時(shí)期）定居南中地區(qū)的漢族豪強(qiáng)勢(shì)力。
【隋唐至兩宋時(shí)代的大理地區(qū)】
【地區(qū)小霸—妙香佛國(guó)】公元581—公元1279年
＊【時(shí)間跨度】隋唐—五代十國(guó)—兩宋【約700年】
＊【政治地位】國(guó)家首都（南詔國(guó)/大理國(guó)）
＊【南詔國(guó)奠基人】皮羅閣 （彝族先民貴族政權(quán)）
＊【大理國(guó)奠基人】段思平 （白族先民貴族政權(quán)）
【延伸點(diǎn)三】今昆明（拓東城\鄯闡城）此時(shí)為東都，國(guó)家副中心。
【延伸點(diǎn)四】 大理 作為正式地方地名（洱海流域）始于元朝時(shí)，大理國(guó)原國(guó)都原名為【羊苴咩城】
▲“蒙舍詔”發(fā)源地巍山
▲天龍八部影視城中的（大理王宮殿群）
▲南詔國(guó)時(shí)期是云南地方政權(quán)最強(qiáng)盛的時(shí)期（網(wǎng)絡(luò)圖片）
【元明清時(shí)期的昆明地區(qū)】
【邊疆大省】公元1271年 — 今
＊【時(shí)間跨度】元—明—清—民國(guó)—今，約700年】
＊【政治地位】行省省會(huì)
＊【省會(huì)改遷主導(dǎo)者】賽典赤-瞻思丁
▲云南省第一任省長(zhǎng)【賽典赤-瞻思丁】（網(wǎng)絡(luò)圖片）
▲明朝云南府～府城-【龜城】（網(wǎng)絡(luò)圖片）
【云南政治中心城市演變過程】{前秦時(shí)代}：【莊蹻故城（苴蘭城）】今晉寧區(qū)晉城鎮(zhèn)——至——{兩漢時(shí)代}：【滇池縣】今晉寧區(qū)晉城鎮(zhèn) ——至——(魏晉南北朝時(shí)代}：【味縣】今曲靖市——至——【同樂縣】今曲靖陸良縣——至——【味縣】今曲靖市——至—— {南詔國(guó)時(shí)期}：【太和城】（今大理市）——至——{大理國(guó)時(shí)期}【羊苴咩城】（今大理市）——至——{蒙元時(shí)期}【中慶路（鴨池）】（今昆明市區(qū)）——至——{明清時(shí)期}【云南府】（今昆明市區(qū)）——昆明縣（民國(guó)）——昆明市（民國(guó)）——地級(jí)昆明市（今）
▲昆明老城小西門 晚清影像（網(wǎng)絡(luò)圖片）
▲大理古城（網(wǎng)絡(luò)圖片）
▲曲靖南城門（網(wǎng)絡(luò)圖片）
昆明重新成為云南政治中心大致有以下原因：＊1.【地理位置優(yōu)越】昆明的地理位置絕佳，大致處于云南的中心位置偏東，便于全省統(tǒng)籌管理，( 云南多山古代交通極為不便，為了減少行政成本和效率，“居中而治”絕對(duì)是居中的昆明也就更容易受到統(tǒng)治者的青睞。還有在一個(gè)就是，昆明地理上比滇西的大理更靠近中原，與元大都往來更方便，利于中央政府統(tǒng)治。)
▲元朝時(shí)期的云南行省地圖（網(wǎng)絡(luò)圖片）
＊2.【自然環(huán)境、水利、農(nóng)耕等條件優(yōu)越】昆明周圍自然環(huán)境優(yōu)越，壩子更加寬闊，且周圍湖泊眾多，水利灌溉條件比較好，利于農(nóng)耕，（滇池、陽宗海、撫仙湖、星云湖等），古代滇池流域之所以產(chǎn)生了云南最早的農(nóng)耕民族古滇人和青銅文明【古滇文明】，離不開肥沃的土地和湖水的滋養(yǎng)，所以【云南有大壩區(qū)+大湖】的糧食高產(chǎn)地在云南并不多。
▲整個(gè)滇池盆地約1000多平方公里（排除旱壩子）是云南最大的平原地區(qū)
＊3.【滇池衰退，北岸城建崛起】古滇池是衰減性湖泊因此平均水位較淺，隨著歷史的發(fā)展，古滇池水位也在不停的下降，唐朝時(shí)滇池面積約500里，到了近代，約330里。北岸大片丘陵和平地已露出水面，北岸平壩面積不斷擴(kuò)大。農(nóng)耕和交通條件均優(yōu)于空間相對(duì)狹小的滇池南岸，北岸取代南岸從此成為昆明地區(qū)城市發(fā)展的重點(diǎn)區(qū)域。自然條件的巨大改觀，也讓后續(xù)的統(tǒng)治者越來越重視滇池北岸的開發(fā)。南詔大理國(guó)時(shí)代作為東都的【拓東城】、【鄯闡城】在滇池北岸得到空前開發(fā)。到大理國(guó)末期，東都鄯闡城已發(fā)展成為滇中一座“商工頗眾”的繁華城市，為后來政治中心轉(zhuǎn)移奠定了基礎(chǔ)。
▲滇池流域城市建設(shè)北岸代替南岸成為中心
▲古滇池水位變化圖
＊4.【便于削弱和控制前朝影響】為了統(tǒng)治，元朝在滅亡大理國(guó)后，并沒有對(duì)前朝皇族趕盡殺絕，而是在大理設(shè)立大理總管（段氏世襲），為了防范和擺脫前朝大理國(guó)時(shí)代的影響，加強(qiáng)控制云南全局，搬遷行政中心到昆明地區(qū)無疑是最佳的決定。
＊5.【昆明在后續(xù)（明清）政治文化人口等資源的高度集中和加強(qiáng)】明朝時(shí)期大量中原人口遷入昆明，昆明漢族首次超過本地土著，明清大力并推行了改土歸流，加強(qiáng)對(duì)西南邊陲的控制。特別清朝將云貴總督署設(shè)置在昆明，不但提高了昆明的政治地位，而且大量的外來移民帶來了中原文化，也促進(jìn)了云南與內(nèi)地省份的經(jīng)濟(jì)文化交流，這無疑加強(qiáng)了昆明政治、經(jīng)濟(jì)、文化，的地位，而偏西的大理地位越來越邊緣化，僅僅作為滇西重鎮(zhèn)，再無力與昆明競(jìng)爭(zhēng)。
▲清朝總督署分布圖
▲云貴總督署舊址（今云南勝利堂）
總而言之，云南歷史的行政區(qū)中心雖有變化，但相對(duì)穩(wěn)定，并不算太頻繁（相比其他省份比如：河北省的省會(huì)和廣西首府可以了解一下）做了500年王都/郡治和700年省會(huì)的昆明歷史沉淀厚重，也造成了云南資源（經(jīng)濟(jì)、文化、醫(yī)療、教育）高度集中昆明，一城獨(dú)大的格局。當(dāng)然話又說回來，事務(wù)發(fā)展有兩面性，大理雖然政治首位度下降，但也因?yàn)槭敲褡遄灾沃?，大致保住了自己城市和民族的文化脈絡(luò)和青山綠水，成為全國(guó)和云南最知名旅游城市之一，也算是塞翁失馬焉知非福。（對(duì)比昆明城市發(fā)展特色的盡失。）
本文結(jié)束，我是倮倮，喜歡/想了解更多云南/昆明交通發(fā)展，歷史文化地方志，可以關(guān)注或查看我的相關(guān)回答，本文結(jié)束，謝謝觀賞，歡迎大家留言討論。第一、歷史的選擇
熟悉云南歷史的讀者都知道，自楚國(guó)莊蹻入滇以來，中國(guó)內(nèi)地中央政權(quán)對(duì)云南地區(qū)的統(tǒng)治始終是局部的和形式上的，云南大部分地區(qū)依然處在地方少數(shù)民族部落政權(quán)實(shí)際統(tǒng)治之下，這個(gè)地方產(chǎn)生過古滇國(guó)、哀牢國(guó)、句町國(guó)、南中國(guó)、 南詔國(guó)、大理國(guó)、象乘國(guó)等多個(gè)少數(shù)民族政權(quán)。 從東晉至唐初400年間， 爨氏家族建立以曲靖為中心的南中政權(quán)， 統(tǒng)治疆域包括今天的云南、貴州和四川西南部，曲靖事實(shí)上是云南第一個(gè)首府；后來南詔國(guó)崛起到大理國(guó)衰落七百余年間，形成比較強(qiáng)大的割據(jù)政權(quán)，南詔國(guó)和大理國(guó)都定都于大理，大理成了云南的第二個(gè)首府；昆明城開拓于南詔國(guó)時(shí)代，為南詔國(guó)和大理國(guó)的別都，今天來講就是副省級(jí)中心城市，直到1276年，元朝統(tǒng)一中國(guó) ，在云南行中書省，云南的首府才由大理遷至昆明，但受元朝中央政府的委托，云南的統(tǒng)治實(shí)際上一直控制在段氏家族手中，所以云南有兩個(gè)統(tǒng)治中心，昆明是首府，大理是別都。
洪武1382年，明軍入滇，結(jié)束段氏對(duì)云南的統(tǒng)治，昆明才成為云南唯一的政治經(jīng)濟(jì)文化中心，也就是云南省的首府?？梢哉f作為省府城市和歷史文化名城，曲靖開創(chuàng)四百年云南首府史，此后，大理和昆明各領(lǐng)風(fēng)騷700年。
第二、經(jīng)濟(jì)社會(huì)發(fā)展的選擇。元代以后，云南省府定都于昆明主要原因是昆明土地肥沃，農(nóng)耕發(fā)達(dá)，當(dāng)時(shí)的經(jīng)濟(jì)社會(huì)發(fā)展水平已比較高。另一方面，昆明地處滇中，地勢(shì)開闊，東西南北的交通出行便利，便于中央政府駐京屯兵，對(duì)云南全局進(jìn)行控制。隨著元朝賽典赤經(jīng)略云南，在昆明興修水利、交通驛站等基礎(chǔ)設(shè)施，昆明與中原的經(jīng)濟(jì)文化聯(lián)系進(jìn)一步加強(qiáng)，成為云南名副其實(shí)的政治經(jīng)濟(jì)文化和軍事中心。
第三、歷史的輪回。首府是一個(gè)地區(qū)的政治經(jīng)濟(jì)文化中心，它通過對(duì)人才、資本、技術(shù)、管理等優(yōu)勢(shì)資源的吸納，會(huì)產(chǎn)生巨大的發(fā)展能量，對(duì)一個(gè)地區(qū)的經(jīng)濟(jì)社會(huì)發(fā)展的帶動(dòng)作用無疑是巨大的，但再?gòu)?qiáng)大的首府，也需要其它城市群支撐平衡，否則會(huì)加劇地區(qū)資源空間配置和城市之間、城鄉(xiāng)之間發(fā)展的不均衡，影響一個(gè)地區(qū)的可持續(xù)發(fā)展。
在過去2000多年里，曲靖、大理、昆明，都曾經(jīng)是云南的首府，在每個(gè)歷史時(shí)段，對(duì)云南的發(fā)展都作出過杰出的貢獻(xiàn)，而今昆明一家獨(dú)大，整個(gè)經(jīng)濟(jì)的總量占云南省近1/3；曲靖是云南第二大的工商城市，經(jīng)濟(jì)總量不到昆明一半，大理經(jīng)濟(jì)總量?jī)H排行全省第五，不到昆明的1/4，三大城市發(fā)展極度不均衡，三市之間產(chǎn)業(yè)同構(gòu)化較高，對(duì)全省區(qū)域經(jīng)濟(jì)社會(huì)發(fā)展的帶動(dòng)能力和輻射能力比較弱。
大理、曲靖都是云南重要的區(qū)域中心城市，要支撐起云南經(jīng)濟(jì)社會(huì)的持續(xù)發(fā)展，除了加速昆明區(qū)域國(guó)際中心發(fā)展外，要對(duì)連結(jié)內(nèi)地的交通樞紐中心城市曲靖和西出東南亞、南亞的交通樞紐中心城市大理給予資源配置上的政策傾斜，發(fā)展成云南經(jīng)濟(jì)的兩個(gè)副中心，形成云南經(jīng)濟(jì)發(fā)展的鐵三角，三強(qiáng)鼎立，三大增長(zhǎng)極、一大東西經(jīng)濟(jì)帶，輻射東西南北中，輻射東南亞南亞，云南的經(jīng)濟(jì)起飛，指日可待也。
